MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 1896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	TGC	2	6	123	128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671660
2	NC_018749	AACT	2	8	164	171	50 %	25 %	0 %	25 %	408671660
3	NC_018749	AAT	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
4	NC_018749	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	408671660
5	NC_018749	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671660
6	NC_018749	ATC	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
7	NC_018749	TTGT	3	12	370	381	0 %	75 %	25 %	0 %	408671660
8	NC_018749	CAA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671660
9	NC_018749	ATT	2	6	473	478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
10	NC_018749	A	7	7	515	521	100 %	0 %	0 %	0 %	408671660
11	NC_018749	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
12	NC_018749	TCC	2	6	543	548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671660
13	NC_018749	AATA	2	8	596	603	75 %	25 %	0 %	0 %	408671660
14	NC_018749	T	6	6	604	609	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
15	NC_018749	T	6	6	652	657	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
16	NC_018749	T	6	6	674	679	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
17	NC_018749	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
18	NC_018749	GGA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671660
19	NC_018749	ATC	2	6	803	808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
20	NC_018749	T	8	8	815	822	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
21	NC_018749	AAT	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
22	NC_018749	T	6	6	995	1000	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
23	NC_018749	TTC	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
24	NC_018749	ATT	2	6	1061	1066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
25	NC_018749	GTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671660
26	NC_018749	ATT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
27	NC_018749	ATT	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
28	NC_018749	TTC	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
29	NC_018749	A	6	6	1197	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	408671660
30	NC_018749	ACT	2	6	1290	1295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
31	NC_018749	TTA	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
32	NC_018749	TAA	2	6	1436	1441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
33	NC_018749	ATT	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
34	NC_018749	CTT	2	6	1514	1519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
35	NC_018749	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
36	NC_018749	CTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
37	NC_018749	CAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
38	NC_018749	AT	3	6	1743	1748	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
39	NC_018749	TTA	2	6	1854	1859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
40	NC_018749	TAGT	2	8	1900	1907	25 %	50 %	25 %	0 %	408671660
41	NC_018749	T	7	7	1947	1953	0 %	100 %	0 %	0 %	408671660
42	NC_018749	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
43	NC_018749	TAA	2	6	1985	1990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
44	NC_018749	TCT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
45	NC_018749	AT	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
46	NC_018749	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671660
47	NC_018749	TGA	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671660
48	NC_018749	TTGA	2	8	2241	2248	25 %	50 %	25 %	0 %	408671660
49	NC_018749	TCT	2	6	2265	2270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671660
50	NC_018749	TAA	2	6	2314	2319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671660
51	NC_018749	A	7	7	2405	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	408671660
52	NC_018749	ATT	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671660
53	NC_018749	ATG	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671660
54	NC_018749	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	408671660
55	NC_018749	TCAT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	408671660
56	NC_018749	TTA	3	9	2661	2669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671661
57	NC_018749	ATTT	2	8	2700	2707	25 %	75 %	0 %	0 %	408671661
58	NC_018749	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	408671661
59	NC_018749	GCT	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671661
60	NC_018749	ATG	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671661
61	NC_018749	ATAA	2	8	2835	2842	75 %	25 %	0 %	0 %	408671661
62	NC_018749	ATA	2	6	2971	2976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671661
63	NC_018749	AAT	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671661
64	NC_018749	TTAA	2	8	2998	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	408671661
65	NC_018749	TTG	2	6	3033	3038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671661
66	NC_018749	GA	3	6	3048	3053	50 %	0 %	50 %	0 %	408671661
67	NC_018749	TGTGT	2	10	3071	3080	0 %	60 %	40 %	0 %	408671661
68	NC_018749	CCAACC	2	12	3097	3108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671661
69	NC_018749	TGC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671661
70	NC_018749	T	7	7	3128	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	408671661
71	NC_018749	AAT	2	6	3144	3149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671661
72	NC_018749	TTCT	2	8	3180	3187	0 %	75 %	0 %	25 %	408671661
73	NC_018749	AATT	2	8	3225	3232	50 %	50 %	0 %	0 %	408671661
74	NC_018749	CAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671661
75	NC_018749	T	6	6	3320	3325	0 %	100 %	0 %	0 %	408671661
76	NC_018749	GAAAA	2	10	3329	3338	80 %	0 %	20 %	0 %	408671661
77	NC_018749	GCCA	2	8	3448	3455	25 %	0 %	25 %	50 %	408671661
78	NC_018749	TTG	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671662
79	NC_018749	AAT	2	6	3866	3871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671662
80	NC_018749	TGGTA	2	10	3889	3898	20 %	40 %	40 %	0 %	408671662
81	NC_018749	ATT	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671662
82	NC_018749	GTA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671662
83	NC_018749	TTA	2	6	4001	4006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671662
84	NC_018749	AGAAA	2	10	4018	4027	80 %	0 %	20 %	0 %	408671662
85	NC_018749	CAC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671662
86	NC_018749	AAC	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671662
87	NC_018749	TTCC	2	8	4190	4197	0 %	50 %	0 %	50 %	408671663
88	NC_018749	CTA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671663
89	NC_018749	GGCA	2	8	4263	4270	25 %	0 %	50 %	25 %	408671663
90	NC_018749	AAT	2	6	4320	4325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671663
91	NC_018749	TAA	2	6	4350	4355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671663
92	NC_018749	GTTG	2	8	4398	4405	0 %	50 %	50 %	0 %	408671663
93	NC_018749	GTTT	2	8	4427	4434	0 %	75 %	25 %	0 %	408671663
94	NC_018749	ACGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	25 %	25 %	408671663
95	NC_018749	CAT	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671663
96	NC_018749	TCC	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671663
97	NC_018749	TCT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671663
98	NC_018749	TCG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671663
99	NC_018749	T	6	6	4831	4836	0 %	100 %	0 %	0 %	408671663
100	NC_018749	GATT	2	8	4878	4885	25 %	50 %	25 %	0 %	408671663
101	NC_018749	CAA	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671663
102	NC_018749	TTC	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671663
103	NC_018749	AAT	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671663
104	NC_018749	TTA	3	9	5095	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671663
105	NC_018749	AAAG	2	8	5155	5162	75 %	0 %	25 %	0 %	408671663
106	NC_018749	CCA	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671663
107	NC_018749	TATT	2	8	5290	5297	25 %	75 %	0 %	0 %	408671663
108	NC_018749	ATT	2	6	5301	5306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671663
109	NC_018749	GTA	2	6	5352	5357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671663
110	NC_018749	ATT	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671663
111	NC_018749	TCAA	2	8	5737	5744	50 %	25 %	0 %	25 %	408671663
112	NC_018749	CAC	2	6	5798	5803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671663
113	NC_018749	GCA	3	9	5806	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671663
114	NC_018749	CGTGG	2	10	5840	5849	0 %	20 %	60 %	20 %	408671663
115	NC_018749	TAT	2	6	5909	5914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671663
116	NC_018749	GGTC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	408671663
117	NC_018749	CCG	2	6	6046	6051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671663
118	NC_018749	GAA	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671663
119	NC_018749	ATC	2	6	6168	6173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671663
120	NC_018749	TTA	2	6	6214	6219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671663
121	NC_018749	T	7	7	6377	6383	0 %	100 %	0 %	0 %	408671663
122	NC_018749	ATT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671664
123	NC_018749	GTT	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671664
124	NC_018749	GCTC	2	8	6813	6820	0 %	25 %	25 %	50 %	408671664
125	NC_018749	ATC	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671664
126	NC_018749	GTA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671664
127	NC_018749	TCG	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671664
128	NC_018749	ACGG	2	8	7126	7133	25 %	0 %	50 %	25 %	408671664
129	NC_018749	CGG	2	6	7138	7143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671664
130	NC_018749	T	6	6	7160	7165	0 %	100 %	0 %	0 %	408671664
131	NC_018749	TGG	2	6	7254	7259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671664
132	NC_018749	A	6	6	7270	7275	100 %	0 %	0 %	0 %	408671664
133	NC_018749	TCGG	2	8	7491	7498	0 %	25 %	50 %	25 %	408671664
134	NC_018749	TAA	2	6	7577	7582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671664
135	NC_018749	ATTT	2	8	7683	7690	25 %	75 %	0 %	0 %	408671665
136	NC_018749	AAT	2	6	7791	7796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671665
137	NC_018749	ACCA	2	8	7801	7808	50 %	0 %	0 %	50 %	408671665
138	NC_018749	TTA	2	6	7865	7870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671665
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141	NC_018749	CAT	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671665
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151	NC_018749	TGGT	2	8	8372	8379	0 %	50 %	50 %	0 %	408671666
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